串联重复变异塑造免疫细胞类型特异的基因表达
发布时间：2026-11-05
信息来源：中国科学报
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发布时间：2026-11-05
信息来源：中国科学报
澳大利亚加文医学研究所的Daniel G. MacArthur团队发现，人类基因组中高度多态、此前难以准确分析的串联重复序列（TR），是塑造免疫细胞类型特异基因表达的重要调控变异来源，并可为免疫与血液相关性状的遗传关联提供机制解释。近日，相关研究成果发表于《自然》。
TR是遍布人类基因组、高度多态的重复序列，也是基因表达的重要调控因子。研究团队在两个队列中获取到来自1925名个体、超过540万个血液来源细胞的全基因组和单细胞RNA测序数据，并通过荟萃分析刻画了超过170万个TR位点的变异对免疫细胞类型特异基因表达的影响。
研究团队鉴定出超过6.9万个单细胞表达数量性状位点，其中30.7%特异于28种免疫细胞类型中的一种，并利用细胞状态推断揭示了动态调控效应。来自922名个体、超过340万个细胞核的配对单细胞转座酶可及性染色质测序数据，为近1/3的表达相关TR揭示了染色质可及性数量性状位点，支持其对顺式调控架构的协同效应。精细定位将1490个TR定位为6.1%受检基因表达变异的候选因果驱动因素；共定位分析则突出了200多个基因，其中TR很可能介导了免疫和血液学性状的遗传关联。
这些结果确立了TR是细胞类型特异调控变异和复杂性状遗传结构的关键贡献者。
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