国际大科学计划FarmGTEx白皮书发布
发布时间：2025-03-26
信息来源：中国科学报
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发布时间：2025-03-26
信息来源：中国科学报
近日，华南农业大学动物科学学院畜牧学科团队与14个国家91个研究机构的研究人员联合，发起国际大科学计划FarmGTEx（农业动物基因型-组织表达）白皮书，并发表于《自然-遗传学》。
农业动物在数千年的驯化和人工选择中积累了丰富的遗传多样性。这些动物在抗病性、生长效率和环境适应性等方面表现出复杂的基因表达模式，但其调控机制尚不明确。为了揭示这些机制、推动畜禽精准育种和人类医学研究，FarmGTEx项目应运而生。该项目计划通过整合全球农业动物的基因组-转录组数据资源，建立农业动物的多组织遗传调控效应图谱，探究农业动物基因表达的遗传决定问题。
FarmGTEx项目自2018年启动以来在农业动物遗传育种研究领域取得了显著进展。项目团队通过对公共数据库的RNA测序和对全基因组测序数据开展清洗整理和深度挖掘，顺利绘制出世界上首批牛、猪、鸡的多组织分子遗传调控效应图谱，构建了牛、猪和鸡的项目数据库，方便全球研究人员使用。此外，包括绵羊、山羊、马、骆驼、兔子、鸭子在内的其他畜禽物种的相关研究正在进行。
FarmGTEx项目将对基础生物学、动物精准育种、环境适应与驯化和人类健康等相关领域产生深远影响。该项目计划分3个阶段实施：试点阶段（2018—2025年）主要探索组织和品种特异性调控对基因表达和可变剪接的影响；第一阶段（2025—2030年）重在揭示性别和发育阶段特异性的遗传调控效应；第二阶段（2030—2035年）将涵盖多种环境条件，每种条件下筛选200个个体的20~40种组织，包括饲养调控、气候条件、健康状况和病原体暴露等因素，并在单细胞或空间转录组等更高分辨率下进行分析。项目还将考虑纳入其他分子表型，如DNA甲基化、染色质可及性和代谢组等多组学数据。（记者 朱汉斌）
相关论文信息：
https://doi.org/10.1038/s41588-025-02121-5
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